取引所ではなく、ロングとショートのポジション保有者同士で直接やり取りされます。先物価格が現物より高ければロングがショートに、低ければショートがロングに支払います。
ファンディングレートが異常に高い状態で同じ方向に追加エントリーすることには注意し、長期ポジションなら必ずファンディングレートを損益計算に含めるべきです。